Usai memutuskan pensiun pada 2001, Thomas Doll mulai merambah karier kepelatihan.
Tim pertama yang ia tangani adalah Hamburger SV U-19 pada 2001. Karier kepelatihannya terus meningkat.
Sampai pada 2004 dirinya dipercaya menangani tim utama Hamburger SV pada 2004.
Satu tahun di tim senior Hamburger SV, Thomas Doll memperlihatkan tren positif. Tepat pada 2005, Hamburger SV berhasil menyabet gelar Piala Intertoto.
Mereka mengalahkan Valencia di final, setelah melalui dua leg pertandingan. Di leg pertama Hamburger SV menang 1-0. Sementara di leg kedua, pertandingan berakhir 0-0. Praktis, tim besutan Thomas Doll menang agregat 1-0.
6. Raih Kejayaan Saat Latih Klub Hungaria
Di sepanjang kariernya sebagai pelatih, Thomas Doll telah menjalani 504 pertandingan, 246 menang, 120 imbang dan 138 kekalahan, 817 memasukan dan 560 kebobolan serta 858 poin.
Bahkan, salah satu prestasi terbaiknya adalah saat menukangi klub asal Hungaria Ferencvarosi TC di tahun 2013-2018.
Pria berusia 56 tahun itu sendiri sudah menjalani 190 pertandingan dengan membukukan 113 kemenangan, 44 hasil imbang dan 33 kekalahan